6月23日 国务院批复山东省人民政府：同意撤销菏泽地区和县级菏泽市，设立地级菏泽市和牡丹区。

　　7月18日 山东省人民政府下发 《关于撤销菏泽地区和县级菏泽市设立地级菏泽市的通知》。

　　12月6日 中共山东省委批准：撤销中共菏泽地委，设立中共菏泽市委(地级)。新任地级菏泽市市委书记李明先、副书记陈光为“中国共产党菏泽市委员会”郑重揭牌，“中国共产党菏泽市纪律检查委员会”一并揭牌。

2001年

　　1月5日至9日，政协第十一届菏泽市委员会第一次会议召开。大会选举杨成训为十一届菏泽市政协主席，选举黄爱菊、聂书江、杨宪文、孟祥伦、潘建荣、张建新、李建军、张建华、肖培树为副主席，选举祝传收为秘书长。

　　1月6日至10日，菏泽市第十五届人民代表大会第一次会议召开，选举李明先为市人大常委会主任，阎世海、潘兴玺、李胜华、范福临、周书运、文廷良、郭仲生、常洪珍、汤建梅为副主任，李顺广为秘书长；选举陈光为菏泽市人民政府市长，杜昌文、贾凤英、李德章、孙义福、朱效明、侯成君、孙述涛、何茂远为副市长；选举张玉佩为菏泽市中级人民法院院长；选举朱献瑞为菏泽市人民检察院检察长。

　　1月10日 菏泽撤地设市庆祝大会在中华影剧院隆重举行。菏泽市中级人民法院、市人民检察院同时揭牌成立。

　　2月 菏泽市被正式命名为中国牡丹之乡。

　　6月25日 经国家证监会批准，我市首家证券营业部——山东证券有限公司菏泽营业部开始试营业。

　　9月28日至10月7日 在全国第五届花卉博览会上，菏泽牡丹以其华贵、典雅的风采再次赢得专家和游人的青睐，共获奖牌22枚，其中金奖3枚，银奖5枚，囊括了专项中全部金奖，获奖总数占牡丹单项奖总数的85％。

　　10月17日至18日 中共中央政治局委员、中共山东省委书记吴官正深入到我市城乡，就党的十五届六中全会精神贯彻落实和进一步加快发展等问题调查研究。

　　10月29日至30日 山东省东西结合加快菏泽发展第三次工作会议在我市召开。

　　10月31日 我市第一座城市立交桥——菏泽双河立交桥竣工通车。

2002年

　　1月7日 山东省人民政府下发 《关于同意筹建菏泽学院的批复》的文件，同意我市关于将菏泽师范专科学校、菏泽教育学院、菏泽广播电视大学合并，同时将菏泽师范学校、菏泽农业学校并入，筹建菏泽学院（暂定名）的方案。

　　1月18日 中国第一头自主完成的成年体细胞克隆牛在曹县五里墩降生。

　　4月9日 中共中央政治局常委、全国政协主席李瑞环与随行的全国政协副秘书长李昌鉴，在山东省委副书记、省长张高丽，省委副书记、省政协主席吴爱英的陪同下，参观了冀鲁豫边区革命纪念馆，走访看望了贫困村和贫困农户，视察了五里墩村养牛基地、九发食用菌公司等农业龙头企业。

　　4月16日 颐海（菏泽）热电厂投产，结束了菏泽没有集中供暖的历史。

　　5月23日 全国平原绿化现场经验交流会在菏泽召开。

　　5月30日 曲菏高速公路提前建成通车。

　　6月6日 我市首例试管婴儿助孕成功。

　　6月9日 青岛至菏泽直通口岸暨青岛港菏泽集装箱场站开通仪式隆重举行。菏泽口岸是山东省惟一一个直通的内陆铁路口岸，它的开通，将对鲁西南及周边地区的经济发展产生重要影响。

　　6月20日 我市行政审批服务中心开始运营，有453项审批项目权限的35个市直部门和单位入驻，实行“一站式”办公、“一条龙”服务、一个“窗口”收费。

　　7月17日 巨野煤田进入实质性开发阶段。

　　8月10日至12日 中共中央政治局委员、中共山东省委书记吴官正来我市调查研究。

　　8月16日 《山东汉子》晋京演出。

　　12月14日 中共山东省委决定：陈光同志任中共菏泽市委书记兼市委党校校长。

　　12月18日 菏泽市十五届人大常委会第十三次会议任命杜昌文为菏泽市人民政府代理市长。

2003年

　　2月17日至21日，中国人民政治协商会议第十二届菏泽市委员会第一次会议举行。大会选举孔令昌为政协菏泽市十二届委员会主席，聂书江、李德章、杨宪文、孟祥伦、朱效明、张建新、李建军、肖培树为副主席，祝传收为秘书长。

　　2月18日至22日，菏泽市第十六届人民代表大会第一次会议举行。大会选举陈光为市十六届人大常委会主任，王祖和、潘兴玺、范福临、朱献瑞、文廷良、郭仲生、常洪珍、汤建梅、潘建荣为副主任，李顺广为秘书长。选举杜昌文为菏泽市人民政府市长，赵润田、何茂远、夏鲁青、王文升、杨永昌、张存金、邵好学、童彩云为副市长。选举孙寿海为菏泽市中级人民法院院长；选举丁伟民为菏泽市人民检察院检察长。

　　4月22日 首届（菏泽）林产品交易会在菏泽国际会展中心隆重开幕。

　　5月29日 中共山东省委副书记、省长韩寓群来菏泽视察黄河防汛工作。

　　6月30日 菏泽牡丹获“国际身份认证”。

　　8月21日至22日 中共山东省委书记、省人大常委会主任张高丽来我市视察指导工作。

　　9月5日至6日 中共山东省委副书记、省长韩寓群，省委常委阎启俊，副省长陈延明带领省直有关部门负责同志来我市检查指导抗洪救灾工作。

　　10月3日 中共中央总书记胡锦涛在刊载（菏泽）黄河滩区灾情情况的《国内动态清样》上作出指示：要采取措施，确保被围困群众的安全，努力减少受灾损失，并安排好群众生活。

　　10月4日 国务院总理温家宝作出批示：请河南省采取措施排除生产堤险情，山东省妥善做好受灾群众转移安置工作，两省要加强协调配合。

　　10月24日 中共中央政治局委员、国务院副总理回良玉来我市视察黄河抗洪抢险救灾和秋种工作。

　　11月10日 中共山东省委书记张高丽视察黄河防汛工作。

　　12月12日至17日 中共中央总书记胡锦涛和随行的中共中央政治局候补委员、中央书记处书记、中央办公厅主任王刚，分别在中共山东省委书记张高丽、省长韩寓群和中共河南省委书记李克强、省长李成玉等陪同下，先后到山东聊城、菏泽和河南商丘、开封等地，深入乡村农户、田间地头、农产品加工企业，就进一步解决好“三农”问题进行调研。

2004年

　　2月3日至4日 省委、省政府召开加快菏泽发展现场办公会议。

　　2月21日 我市十大城市建设工程之一的赵王河公园建设开始启动，相关的拆迁动员会议在中华影剧院召开，实现菏泽“花城、水邑、林海、商都”城市建设目标。

　　4月10日 菏泽火车站新候车大楼启用。

　　4月24日 山东省人民政府《关于商请国家林业局联合举办2004年度中国林产品交易会及建立中国林产品交易会常设会址的函》上报以后，国家林业局经研究作出批复，同意菏泽市被定为全国林产品交易中心。

　　5月17日 菏泽师专升格为菏泽学院。

　　6月30日 中共山东省委副书记、省长韩寓群来菏泽视察黄河防汛工作。

　　8月31日 菏泽口岸新址与青岛港实现直通仪式举行。

　　10月15日至30日 菏泽市在广交会成交额创历史之最。

　　12月7日 市委、市政府在济南隆重召开“实施'突破菏泽'战略加快六大产业发展研讨会”。

　　12月10日 中共山东省委书记张高丽就关于大力支援菏泽加快发展作出批示。

2005年

　　3月15日 菏泽市污水处理工程竣工（试运行）典礼举行。

　　4月 环城公园一期工程全面完工。

　　5月10日 省委、省政府在菏泽召开加快菏泽发展调度会。

　　10月4日 菏泽牡丹在第六届中国花卉博览会上囊括牡丹专项奖全部金奖。

　　10月16日 世界冻结深度最深的郭屯煤矿主井井筒正式挖出第一罐土，标志着鲁能菏泽煤电公司郭屯煤矿一期工程正式开工。

　　10月22日 中共陕西省委书记、省人大主任李建国来菏泽参观考察。

　　12月26日至27日 中共山东省委书记、省人大常委会主任张高丽，省委常委、宣传部长王敏以及省直有关部门负责人来菏，就搞好社会治安综合治理、加强文化市场管理、关心困难群众生产生活等进行调查研究。

2006年

　　1月27日至29日 中共中央政治局常委、国务院总理温家宝来到山东菏泽农村，与群众共度春节。中共山东省委书记、省人大常委会主任张高丽，省委副书记、省长韩寓群陪同。

　　3月2日菏泽市十六届人大常委会召开第二十六次会议，接受杜昌文辞去菏泽人民政府市长职务的请求，任命赵润田为代理市长。

　　4月1日 菏泽市经济开发区和各县区的九个工业园区一次性通过国家发改委的审查，全市由一个省级开发区发展到十个省级开发区，这是我市开发区建设史上的重大突破。

　　5月14日 菏泽市第十六届人民代表大会第五次会议选举赵润田为菏泽市人民政府市长。

　　5月18日 全国政协原副主席孙孚凌到单县考察生物发电项目。

　　8月8日 菏泽发电厂三期工程正式投产发电。

　　8月9日至10日 全省加快菏泽发展情况调度会在菏泽召开。

　　9月19日 菏泽荣膺“中国投资潜力型城市”称号。联合国工业发展组织中国投资环境专家组在中国林展馆正式授牌菏泽“投资潜力型城市”，用事实和权威证明了菏泽投资环境的改善已渐入佳境。

　　9月26日 菏泽大剧院初步设计方案通过专家评审。

　　10月29日 我市荣获全面小康与新农村建设 “中国十大政府创新典型”。

　　11月4日 济菏高速跨日东高速互通立交桥提前7个月竣工。

　　12月31日 洙水河航道改造工程开工建设，预计两年内完工。改造后洙水河将成为我市经济上的黄金水道、环境上的生态水道和交流上的友谊通道。

2007年

　　4月30日 菏泽至关庄高速公路通车，打通了山东与河南的省际通道。

　　5月15日至17日，中共山东省委书记李建国率省直有关部门负责人来菏泽调研。

　　7月5日 中国（单县）尚舜化工控股有限公司在新加坡证券交易所成功上市，宣告菏泽没有上市企业的历史结束。

　　9月1日 东明石化跻身中国企业500强，成为菏泽市有史以来第一家入围中国企业500强的企业。

　　9月26日 东明恒昌化工有限公司（东明恒昌化工控股有限公司）在新加坡上市，这是继中国（单县）尚舜化工控股有限公司上市后，我市第二家在新加坡上市的企业。

　　9月29日 引黄供水工程竣工启用，标志着菏泽结束了靠近黄河喝不上黄河水的历史。

2008年

　　1月2日 中国民间文艺家协会命名巨野县为 “中国麒麟之乡”。

　　1月4日至7日 政协第十三届菏泽市政协委员会第一次会议举行，大会选举贾凤英为十三届菏泽市政协主席，选举梁抗美、朱效明、张建新、李建军、何茂远、李学军、张莹、孙凤云为副主席，选举胡卫东为秘书长。

　　1月5日至8日，菏泽市第十七届人民代表大会第一次会议召开。大会选举陈光为市第十七届人大常委会主任，杨永昌为市人大常委会第一副主任（正厅级），汤建梅、邵好学、刘金俊、李玉华、马春田、彭靖华为副主任，赵普为秘书长。选举赵润田为菏泽市人民政府市长，王浩、李卫国、张存金、段伯汉、李法洪、朱培吉、黄秀玲为副市长。选举孙寿海为菏泽市中级人民法院院长；选举丁伟民为菏泽市人民检察院检察长。

　　1月11日 省委、省政府、省军区在济南隆重召开全省双拥模范城（县）命名表彰大会，我市被命名为“全省双拥模范城”。

　　2月15日 中共山东省委决定，赵润田任中共菏泽市委书记、市委党校校长，提名为市人大常委会主任候选人。

　　2月29日 市委第十一届三次全体扩大会议召开。会议的主要任务是，进一步统一思想认识，明确任务目标，动员全市各级各部门，切实转变作风、真抓实干，不断巩固和发展菏泽的大好形势，真正实现科学发展、和谐发展、跨越发展、更好更快发展。在工作要求上，必须做到“高境界、高标准、高效率、高效益”。

　　3月1日市第十七届人大常委会第一次会议召开，任命刘士合为市人民政府副市长、代理市长。

　　4月4日至6日 省委书记姜异康在菏泽调研。

　　4月13日上午 市委隆重召开全市“万名干部下乡”活动动员大会，安排部署“万名干部下乡”活动。

　　4月19日 亚洲最大的炼焦煤选煤厂在龙固矿井建成投产，设计入洗能力为六百万吨/年。

　　5月26日 市委召开常委会议，研究部署进一步做好支援四川抗震救灾工作，要不讲条件，不惜代价，全力以赴，切实把支援绵阳救灾各项工作组织好、落实好、完成好。

　　6月3日 中共山东省委副书记、省长姜大明来菏泽调研。

　　6月11日 我市荣获“生态市建设先进市”称号。

　　6月22日“小升初”学生就近免试入学。

　　7月25日 菏泽市第十七届人民代表大会第二次会议选举赵润田为市人大常委会主任，选举刘士合为菏泽市人民政府市长。

　　8月 菏泽市被省委、省政府命名为“全省创建文明城市工作先进城市”。

　　10月28日 全市城镇居民基本医疗保险启动。

　　11月13日 在2008中国节庆高峰论坛暨全国节庆年会上，我市首次入围并荣获 “2008年度中国优秀节庆城市”称号。

　　12月10日 菏泽连续6次被授予 “全国无偿献血先进城市”。

　　12月15日 菏泽试点公选市直正职领导干部。

2009年

　　1月15日 在国家级非物质文化遗产名录菏泽入选项目标牌颁发仪式上公布的2008年第二批国家级非物质文化遗产名录中，我市入选项目20项，涉及民间文学、传统音乐、传统舞蹈、传统戏剧、曲艺、美术和手工技艺等领域，居全省第一位、全国地级市第二位。

　　2月21日至25日 市委书记、市人大主任赵润田率党政考察团到东部地区学习考察。

　　4月18日 外交部原部长李肇星，总后勤部原部长谭悦新一行来菏泽参观考察。

　　5月20日 经过一年多的紧张施工，我市重点工程--菏泽演武楼建设工程竣工。

　　8月6日 牡丹区退伍军人张玉贵被列为全国重大典型，人民日报、新华社、中央电视台等14家中央媒体及所属新闻网站对其先进事迹进行全方位的集中采访报道。

　　8月11日 我国首例鲁西黄牛胚胎保种在鄄城试验成功。

　　9月2日 市委书记、市人大主任赵润田会见瑞典耶夫勒堡省省长一行。

　　9月4日我市在全省率先完成村卫生室建设任务，实现四级医疗卫生服务网络“全覆盖”。

　　9月27日 全运会圣火在菏泽市传递。

　　10月14日 第十一届运动会武术散打比赛在菏泽演武楼正式开赛。

　　11月14日沿黄公路全线竣工，全长97.8公里。

2010年

　　1月4日 2009年全市地税收入跃上40亿元台阶，增幅居全省第一位。

　　1月25日我市荣膺“中国优秀旅游城市”称号。

　　1月27日全市城乡建设工作会议召开，确定将城市建设将“一年一大步，三年大变样”。

　　3月21日 全国首条日产700吨超白浮法玻璃生产线在巨野投入运营。

　　3月25日国家牡丹高新技术产业基地落户菏泽。

　　3月26日至27日 全国人大副委员长、全国妇联主席陈至立来菏泽检查指导工作。

　　4月2日至4日 中共山东省委书记、省人大主任姜异康来菏泽调研。

　　4月7日至10日 菏泽市组织经贸代表团赴重庆进行经贸对接活动。市委书记、市人大常委会主任赵润田作为山东省党政代表团成员，出席鲁渝经贸合作项目签约仪式、“渝鲁相互支援·经济合作展”剪彩仪式并参观展览。

　　4月10日 曹州牡丹园提升改造竣工庆典举行。

　　6月3日 中共山东省委副书记、省政协主席刘伟来菏泽调研。

　　8月18日 菏泽市与濮阳市缔结友好城市。

　　9月17日 菏泽发现元代木质沉船。

　　12月18日 中共中央政治局常委、全国政协主席贾庆林在中共山东省委书记、省人大常委会主任姜异康，省委副书记、省长姜大明，省委副书记、省政协主席刘伟陪同下，来我市调研考察。