该县积极开展中医医院对口支援中医药服务能力建设工作，强化基层医疗机构中医药服务。2016年，全县18处镇区办卫生院、社区卫生服务中心全部开设了中医科，建立了中药房。并建成国家级“国医馆”2处、省级“国医堂”2处、市级“国医堂”4处，在建市级“国医堂”8处。
巨野县制定政策，提高中药饮片在新农合、城镇职工医疗保险中的报销比例，提倡鼓励临床应用中医疗法，推广使用中药饮片。今年以来，中药饮片销售和报销比例较去年同期增加10%。
投资5000万元，建设巨野县中医院新院，3.5万平方米的新院区已投入运营，并通过了二级甲等中医院验收；县人民医院建设了规范的门诊中药房，开设了两个中医门诊。北城医院疼痛专科被确立为国家中医骨伤治疗示范基地。
科研攻关，提高中医诊疗水平。县中医院设立名中医工作室，专人专室，挂牌服务。医院针灸科是省重点科室。目前，中医疗法已广泛用于颈腰腿疼、肩周炎等多种农村常见病治疗，疗效显著，得到患者一致认可。
建设中药材种植基地。目前，巨野牡丹、万寿菊、丹参等中药材种植面积达到5万亩。今年，巨野县又引进扩大了西红花种植，目前长势良好。
