除了穆罕默德，受到起诉的还包括瓦利德·本·阿塔什、阿里·阿卜杜勒·阿齐兹·阿里、穆斯塔法·艾哈迈德·胡萨维和拉姆齐·比纳尔希布。根据诉状，这5人被控策划并实施2001年9月11日发生在纽约、华盛顿和宾夕法尼亚州尚克斯维尔的恐怖袭击，造成2976人死亡。

　　这5人被控的罪名涉及恐怖主义、劫机、谋杀、袭击平民、袭击平民目标、故意伤害和损坏财物。五角大楼方面建议对这5人实施联合审判。根据2009年通过的《军事委员会法》，他们最高可获死刑。根据该法案，负责审理此案的军事委员会方面将指定一名军法官审案，并于30天内在美军关塔纳摩监狱开始庭审程序。五角大楼方面说，已为这5人提供了有处理死刑案件经验的律师。